Όπως προκύπτει από τελευταίες μετρήσεις του Αριστοτέλειου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης, στα δύο διασυνοριακά ποτάμια της χώρας μας τα προβλήματα της ρύπανσης είναι σοβαρά.
Τα νερά του Αξιού και του Νέστου μπορεί να εισέρχονται στη χώρα μας ρυπασμένα από τις γείτονες χώρες, δέχονται όμως επιπλέον επιβάρυνση από βιομηχανικά απόβλητα, αστικά λύματα και χρήση φυτοφαρμάκων και λιπασμάτων επί του ελληνικού εδάφους.
Σύμφωνα με τη WWF Ελλάς, ο περισσότερο επιβαρημένος ποταμός της χώρας είναι ο Έβρος, με τον Αξιό να ακολουθεί τα βήματά του.
